Технология

Как краудфандингът и изследванията с отворен код ще се борят с рака

Проект Исак Йонемото Изследване на рак на Мерилин

Източник: Indysci.org

Какво означава изследователският подход с отворен код за рака? Как краудфандингът ще помогне за по-бързото разработване на по-добри лекарства? Как ще направим данните на изследователския проект достъпни за всеки, отварящи нови пътища за научни изследвания и иновации? Химик, който пише софтуер от детството си, има за цел да разбере.

Изследовател на име Исак Йонемото прилага някои от концепциите на софтуерни инициативи с отворен код към изследванията на рака. Yonemoto предприема Проект Мерилин , кампания за разработване на безпатентно противораково лекарство. Проектът възкресява изследванията на противораково съединение, наречено 9-деоксисибиромицин , or9DS, което в ранните тестове е доказано ефективно срещу няколко вида рак. Проектът Мерилин също се стреми да промени начина, по който наркотиците се изследват и освобождават. The предложение за проект обяснява:



„Социалната цел е да се демонстрира, че приложните фармацевтични изследвания могат да бъдат финансирани с помощта на модела за масово финансиране и че резултатите могат да бъдат предоставени на публично достояние, непатентовани. В крайна сметка целта на социалната цел е да насърчи производителите да произвеждат евтини лекарства, подобрявайки достъпа до тези лекарства. '

Сибиромицин, основното съединение на 9DS, първоначално е изследван през 70-те години на миналия век от сибирски учени, които смятат, че има потенциал за лечение на рак. „Това е токсично съединение, произведено от почвените бактерии и функционира чрез спиране на репликацията на ДНК. Следователно, той има потенциал като противораково химиотерапевтично средство, ” обяснява предложението на Мерилин за проекта. Те обаче откриха, че той е кардиотоксичен, причиняващ стрес на сърцето, и спряха изследванията си. Проект 9DS е разработен от Барбара Гератана от Университета в Мериленд, Колидж Парк, когато тя разработва метод за производство на аналози на сибиромицин без кислороден атом, за който се смята, че причинява кардиотоксичността. Премахването на кислородната молекула елиминира страничните ефекти и всъщност прави лекарството по-ефективно.

След това Джератана се зае с работа в Националния здравен институт и не можа да продължи изследванията. Малко вероятно е фармацевтичните компании да спонсорират изследването, тъй като тя вече е публикувала резултатите си без патент. Но тъй като произведението не е патентовано, то вече е публично достояние. Тук идва Yonemoto. „Защо да правим лекарства без патенти?“ уебсайтът Indysci.org пита.

„Когато Салк и Сабин излекуваха полиомиелит, те не патентираха ваксината. Време е да разработим безпатентно противораково лекарство за 21 век. Подобно на фармацевтичната индустрия днес, софтуерната индустрия е била исторически доминирана от големи компании и бази на собствени кодове. Днес най-широко използваната операционна система на планетата - Android - е с отворен код. Всеки може да копира и персонализира кода, за да отговори на специфични нужди или да подобри кодовата база за цялата общност. Докато изследвате мрежата, ще видите съдържание и услуги, доставени от или направени възможни от проекти с отворен код като Linux, Wikipedia, WordPress и др. '

къде отиде Роджър Стаубах в колеж

Очаква се проект 9DS да бъде ефективен срещу меланома, бъбречния рак и тройно отрицателния рак на гърдата. С малки промени в молекулата, съединението може да бъде ефективно и срещу повече видове рак. До момента проектът е получил обещания за почти 15 000 долара от целта си за 50 000 долара, плюс почти 2800 долара в биткойн; 50 000 долара ще финансират проекта за около шест месеца. През това време Yonemoto планира да произведе повече 9DS и да представи съединението на ксенографтно изследване, за да измери ефикасността на лекарството срещу определени линии рак (което ще бъде под формата на „излекуване на рак при мишки“, както обяснява сайтът) .

„Това е следващата стъпка в разработването на лекарства и важна по пътя към извършване на клинични (човешки) изследвания“, отбелязва Йонемото. „Ако получим повече финансиране, ще добавим разтегнати цели, като по-нататъшни предклинични експерименти върху 9DS, разработка на 9DS аналози или други вълнуващи идеи за борба с рака.“ Проектът, ръководен от Йонемото и Евън Пауърс, съизобретателят на лекарството Тафамидис, ще осигури независим преглед на усилията му. Кабелен научи, че Йонемото възнамерява да го направи публикувайте данните от Project Marilyn открито, вероятно на GitHub, където разработчиците редовно хостват софтуерни проекти с отворен код.

Wired’s Робърт Макмилан също така отбелязва, че тактиката за набиране на средства на Yonemoto противоречи на стандартния метод за изследване на наркотици, но представлява връщане към методите за изследване на лекарства от средата на века, като ваксината срещу полиомиелит, която е разработена и разпространена без ограниченията на патентите. Йонемото каза на Макмилън, че „Биологията става все по-скоро като дисциплина в областта на компютърните науки“, като преходът се ускорява от технологичния напредък като компютърното секвениране на човешкия геном.

каква нетна стойност има птица лари

Докато технологията за последователност на цял човешки геном съществува само от около 15 години, силната връзка, която тя изгради между компютърните науки и биологията, направи все по-възможно изследователите да подхождат към медицинските изследователски проекти по същия начин, по който разработчиците биха се справили с процеса на проектиране на голяма софтуерна система. Съоснователят на Google Сергей Брин смята мутацията в собствените си гени като грешка в личния си код и идеята да се използва изчислителната мощ на Google за задвижване на медицински изследвания стои зад собствените изследвания на Google, като базовото проучване на Google X, и неговата подкрепа за други начинания като Calico, който изследва стареенето, невродегенеративните заболявания и рака.

Изследвайки генетиката, както биха изходния код, изследователите се възползват и от ниската цена на неща като секвениране на цял човешки геном, който сега струва около 1000 долара , както обясни в MIT Франсис де Соуза, президент на Illumina, производител на машини за секвениране на ДНК Technology Review’s Конференция EmTech. Той изчисли, че тази година 228 000 човешки генома ще бъдат секвенирани от изследователи по целия свят и че секвенирането често се използва за насочване на лечението на различни видове рак. Illumina смята, че пазарът на високоскоростни ДНК изследвания може да достигне 20 милиарда долара годишно, като половината от това е свързано с изследване на заболявания като меланом, рак на белия дроб или мозъчни тумори.

GeneHub е стартираща компания в Сан Франциско, която стартира и след това анулира Kickstarter кампания да се финансира стартирането на услуга, която да предлага цялостно секвениране на генома на индивиди. (Кампанията беше отменена поради запазени търговски марки, притежавани от друга компания за геномика, която ще изисква GeneHub да ребрендира.) Стартирането все още възнамерява да предложи първата услуга за секвениране на генома, достъпна за всеки и обяснява мотивацията си:

„През 11-те години от завършването на проекта за човешкия геном академичните институции не постигнаха голям напредък в разбирането на изумителното разнообразие, изразено в генома на хората. Едва разбираме как вашите гени ви правят, вие. Този проблем няма да бъде решен в лаборатория с липсата на обмен на данни и затворен манталитет „публикувай или загини“, но като дадеш на вас и други блестящи хора достъп до собствения си геном и ви даде възможност да изследвате, споделяте, анализирате, и контролирайте собствения си геном. „

Докато GeneHub се надява да изгради бизнес, като предлага секвениране на геноми като услуга, неговите стремежи също са в съответствие с стремежите на Yonemoto да направи медицинските данни по-достъпни и отворени за изследване от различни хора. По същия начин, по който разработчиците правят своя софтуер с отворен код с надеждата, че други могат да разширят възможностите му по-нататък, и в нови посоки, направянето на медицински и генетични изследвания с отворен код или широко достъпни в крайна сметка може да доведе до важни открития за изследователите, борещи се с рак и други заболявания .

Но това не е преди това уникално пресичане на биологията и компютърните науки да преодолее няколко предизвикателства. Един от тях е проблемът с имиджа: схващането, че финансираните от масово финансиране здравни проекти заобикалят традиционния процес на партньорска проверка, който дава вяра на научните твърдения. Проектът „Имунитет“, проследяващият активността GoBe и скаутът „Сканаду“ придадоха известна валидност на тази опасност. Докато стартиращите компании се стремят да демократизират медицинската информация и научните изследвания, за тях ще бъде от решаващо значение да могат да докажат своите хипотези и да демонстрират потенциала на своите лекарства или технологии.

Възможно е също така изследователските проекти с отворен код също да трябва да намерят начин да наберат повече пари, отколкото могат чрез краудфандинг, тъй като са необходими огромни суми за разработване и производство на лекарство. Ако бъдат изпълнени добре, инициативи като Project Marilyn служат не само за демонстриране на научната валидност на дадено лекарство или лечение, но могат да привлекат повече изследователи и инвеститори към проекта. Това може да започне да обещава нови области на изследване и евентуално да съкрати прословутия дълъг процес на разработване и тестване на нови лекарства и лечения - което означава, че когато Yonemoto или друг изследовател финализира следващото важно противораково лекарство, те могат да получат тази иновация от лабораторията до реална -животните пациенти малко по-бързо.

Още от Tech Cheat Sheet:

  • 4 джаджи тази седмица: Къща с отворен код, Smart Pan и др
  • Ето как технологичните компании плащат за целия този безплатен софтуер, който използвате
  • 4-те най-големи игри, стартиращи следващата седмица